45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3576 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  376  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  30.9 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  23.08 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  24.73 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  24.18 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  23.95 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  23.95 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  23.95 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  23.95 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  31.37 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  24.62 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  30.52 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  29.87 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  29.87 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  25.86 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  23.47 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  29.87 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  29.87 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  21.79 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  21.47 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  29.41 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  25.73 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  25.73 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  28.76 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  25.86 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  22.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  22.89 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  25.86 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  27.01 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  22.7 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  23.17 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  24.53 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0385  general secretion pathway protein H  24.69 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  25.96 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  23.38 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  20.42 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  29.07 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  26.97 
 
 		 193 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  27.59 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  24.53 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>