36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1474 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  81.01 
 
 		 179 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2856  general secretion pathway protein H  48.6 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1416  general secretion pathway protein H  48.04 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0007  general secretion pathway protein H  40.54 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.183951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  27.07 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  26.7 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  27.44 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  27.44 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  27.44 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.83 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  26.83 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  26.98 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  25.4 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  26.46 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  26.4 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  24.85 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  23.67 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  22.45 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  26.4 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  29.34 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  23.17 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  25.56 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  26.29 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  28.21 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  28.21 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  25.86 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  28.21 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  25 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  28.21 
 
 		 187 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  22.16 
 
 		 177 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>