49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2390 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  100 
 
 
180 aa  352  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  46.45 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  38.25 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  29.51 
 
 
190 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  27.87 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  28.8 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  28.8 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  28.8 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  28.8 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  29.51 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  29.73 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.41 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  35.95 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  31.14 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  26.63 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  26.63 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  30.54 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  28.34 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  24.86 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  27.03 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  27.32 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  23.64 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  24.86 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  24.87 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  21.47 
 
 
187 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
196 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  31.58 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  29.24 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  25.56 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  47.17 
 
 
200 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  26.74 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  32.85 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  25.56 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  30.99 
 
 
193 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  29.81 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  31.46 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  30.21 
 
 
174 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  40.62 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  38.6 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.09 
 
 
187 aa  40.8  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>