48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3941 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  88.6 
 
 
193 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  79.27 
 
 
191 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  75.17 
 
 
196 aa  231  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
199 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
199 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
199 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
199 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
199 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
199 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  73.51 
 
 
196 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  78 
 
 
189 aa  227  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  74.69 
 
 
210 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  76.97 
 
 
189 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  75.66 
 
 
189 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  75.66 
 
 
189 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  75.66 
 
 
182 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  77.4 
 
 
182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  59.01 
 
 
177 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  44.52 
 
 
166 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  42.36 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  42.36 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  35.76 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  41.4 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  41.58 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  35.46 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  32.28 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  32.87 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  32.87 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  37.14 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  38.75 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  30.68 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  38.61 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  29.7 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  34.62 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  30.99 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  29.29 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  27.63 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  41.51 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  29.03 
 
 
167 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  55.88 
 
 
145 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  32.26 
 
 
129 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  55.88 
 
 
145 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  55.88 
 
 
145 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>