91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0232 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 185 aa  360  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  38.25 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  41.82 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  30.46 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  30.46 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  30.46 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  30.46 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  29.63 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  31.93 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  29.94 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  30.54 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  31.38 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  29.23 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  34.93 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  32.21 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  32.21 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  27.92 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  27.92 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  30.72 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  29.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  31.75 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  38.36 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  31.02 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  27.92 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  27.92 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  37.84 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  37.37 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  21.93 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  21.93 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  21.93 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  21.93 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  38.24 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  21.93 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  28.48 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  42.65 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  29.14 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  27.5 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  39.73 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  32.35 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  35.9 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  38.67 
 
 		 156 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  44.64 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  35.63 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 159 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.03 
 
 		 168 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  40.79 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 701 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  35.71 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  40.3 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  40.3 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  28.43 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  35.71 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>