57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0012 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  88.78 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  88.78 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  88.78 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  88.78 
 
 		 196 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  88.78 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  88.78 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  88.27 
 
 		 199 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  80.49 
 
 		 189 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  74.3 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  82.47 
 
 		 182 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  75.84 
 
 		 193 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  84.25 
 
 		 182 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  81.94 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  75.17 
 
 		 193 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  80.65 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  80.65 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  80.54 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  55.26 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  43.33 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  43.84 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  37.33 
 
 		 149 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  40.67 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  34.44 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  38.99 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  43.02 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  41.49 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  43.06 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  32.56 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  38.75 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  34.51 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  38.03 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  35.16 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  29.08 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  29.08 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  29.08 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  28.37 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  28.37 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  34.65 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  27.72 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  28.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  36.79 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  42.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  40.98 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  43.06 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  25.49 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.17 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  35.48 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1383  general secretion pathway protein H  37.04 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  33.67 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.24 
 
 		 172 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  28.95 
 
 		 148 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>