61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3075 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  83.12 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  79.27 
 
 		 193 aa  254  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  80.54 
 
 		 196 aa  243  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  77.22 
 
 		 196 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  81.21 
 
 		 189 aa  225  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  81.63 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  79.87 
 
 		 182 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  78.57 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  77.27 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  77.27 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  80.14 
 
 		 182 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  56 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  44.14 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  45.21 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  42.07 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  42.07 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  39.74 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  33.99 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  44.05 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  39.81 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  35.34 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  33.56 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  31.55 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  32.31 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  32.31 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  30.3 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  34.01 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  31.13 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  29.29 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  26.81 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  42.27 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  29.73 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  27 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  32.79 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  27 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  27 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  27 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  25.53 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  25.53 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  30.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  38.36 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  25.53 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  46.15 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  46.15 
 
 		 150 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  26 
 
 		 190 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  37.7 
 
 		 202 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.4 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.7 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>