51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0047 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 182 aa  357  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  99.45 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  84.53 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  83.43 
 
 		 189 aa  270  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  83.43 
 
 		 189 aa  270  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  93.51 
 
 		 189 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  93.38 
 
 		 210 aa  263  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 199 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 199 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 199 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 199 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 199 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 199 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  83.33 
 
 		 196 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  83.12 
 
 		 196 aa  258  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  68.85 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  72.78 
 
 		 193 aa  240  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  75.3 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  51.63 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  43.92 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  44.52 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  37.82 
 
 		 149 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  40.27 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 150 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  40.69 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  40.76 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  33.97 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  45.16 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  35.34 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  35.45 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  35.45 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  29.41 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  39.8 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  39.36 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  32.97 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  31.11 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  37.8 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.65 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  36.36 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  36.59 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.81 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  36.67 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  34.26 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>