66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3195 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  57.33 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  56.67 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  46.9 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  35.29 
 
 		 196 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 199 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 196 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  35.71 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  35.95 
 
 		 210 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  34.87 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  33.55 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  35.06 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  53.62 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  35.67 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  34.9 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  39.2 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  32.68 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  30.72 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  42.25 
 
 		 182 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  42.25 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  41.43 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  40.79 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  42.25 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  38.95 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  34 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  33.56 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  33.85 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  35.14 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  31.17 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  32.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  29.27 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  41.38 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  28.05 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  27.71 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0385  general secretion pathway protein H  36.14 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  29.03 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  27.71 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  25.96 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  42.47 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  27.71 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  29.81 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  27.71 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  34.21 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 		 187 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  34.21 
 
 		 187 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  27.03 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  33.75 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  73.91 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  24.68 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  69.23 
 
 		 196 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  73.08 
 
 		 158 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>