28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1322 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 129 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  62.1 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  62.1 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  57.6 
 
 		 187 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  56.45 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  56.62 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  58.06 
 
 		 188 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  51.94 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  55.2 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  47.59 
 
 		 176 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  51.15 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  37.7 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  36.07 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  37.86 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  32.79 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  35.48 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  32.26 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  35.48 
 
 		 193 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  41.86 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  41.86 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  44.19 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>