78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2203 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 148 aa  289  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  46.9 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  45.21 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  42.66 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  38.03 
 
 		 187 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  44.64 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  44.64 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  35.66 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  38.06 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 189 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 210 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  43.62 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  42.55 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  40.78 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  41.41 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  41.49 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  40.78 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  34.06 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  33.1 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  38.83 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  36.36 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  36.17 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  33.54 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  41.86 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  35.66 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  26.81 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  31.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  31.71 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  39.39 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  40 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  31.71 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  37.58 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  31.71 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  31.71 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  24.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  34.72 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  33.58 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  23.16 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  23.96 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  31.85 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  46.34 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  27.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  24.75 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  24.75 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  24.75 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  24.75 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1050  general secretion pathway protein H  39.76 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  32.76 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1091  general secretion pathway protein H  39.76 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1383  general secretion pathway protein H  47.06 
 
 		 134 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  26.89 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  27.66 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  22.73 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  26.57 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.74 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  31.63 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1047  general secretion pathway protein H  39.29 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  27.92 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  31.82 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  29.2 
 
 		 162 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>