53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3239 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 189 aa  376  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  90.48 
 
 		 189 aa  314  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  89.42 
 
 		 189 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  89.42 
 
 		 189 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  78.57 
 
 		 210 aa  276  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  92.86 
 
 		 182 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  75.27 
 
 		 196 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  95.21 
 
 		 182 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  81.76 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  81.76 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  81.76 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  81.76 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  81.76 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  81.76 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  85.23 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  71.68 
 
 		 193 aa  244  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  78 
 
 		 193 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  73.86 
 
 		 191 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  52.32 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  43.98 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  44.52 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  38.71 
 
 		 149 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  35.71 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  41.33 
 
 		 164 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  41.45 
 
 		 164 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  41.29 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  34.46 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  35.34 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  32.87 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  33.8 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  33.56 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  29.29 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  32.06 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  41.27 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  30.69 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  29.05 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  33.06 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 150 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  36.67 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  26.24 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>