61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2033 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 172 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  98.26 
 
 		 172 aa  331  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  63.41 
 
 		 193 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  32.65 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  29.22 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  33.74 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  28.83 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  30.54 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  26.38 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  27.38 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  29.65 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  27.66 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  29.52 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  32.72 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1412  outer membrane secretion protein U  40.46 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0334434  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  27.06 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  26.47 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  29.95 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  26.47 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  25.88 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  25.88 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  28.77 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  28.16 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  28.57 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  26.57 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  26.57 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  27.03 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  27.56 
 
 		 210 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  26.88 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  38.14 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2302  general secretion pathway protein H  28.99 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  29.86 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  32.21 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  29.75 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  24.28 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  36.05 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  43.94 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.77 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  65.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  33.67 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  36.56 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 130 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  25.82 
 
 		 179 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  74.07 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  36.23 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.86 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>