50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03960 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  56.19 
 
 		 202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  33.16 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  36.93 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  37.78 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  34.1 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  35.26 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  34.15 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  32.37 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  32.37 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  32.37 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2302  general secretion pathway protein H  35.56 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  30.41 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001888  general secretion pathway protein H  38.1 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  36.42 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  33.73 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  28.82 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  28.16 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  33.12 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  33.12 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  34.34 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  33.54 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  36.57 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00605  general secretion pathway protein H  35.04 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  31.18 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  25.62 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  27.49 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  32.52 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  32.52 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  32.52 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  32.52 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  29.44 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  24.71 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  32.18 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  25.7 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  28.99 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1412  outer membrane secretion protein U  27.07 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0334434  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  27.81 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  27.49 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  27.49 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.9 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  26.9 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02784  hypothetical protein  30.13 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000039643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  28.71 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1416  general secretion pathway protein H  28.96 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0727  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 137 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.807557  normal  0.202757 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  29.03 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>