65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2920 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001888  general secretion pathway protein H  50.78 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00605  general secretion pathway protein H  51.79 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2302  general secretion pathway protein H  46.35 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  32.98 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  33.94 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  32.98 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  31.79 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  31.94 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  30.89 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  31.94 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  31.94 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  30.38 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  25.26 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  24.73 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  24.74 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  24.74 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  24.74 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  27.72 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  34.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  30.29 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  30.29 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  28.07 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  26.44 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  30.63 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02784  hypothetical protein  22.1 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000039643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  31.06 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  31.01 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  30.38 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  26.9 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  29.3 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  29.24 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  29.11 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  25.89 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  23.88 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  28.93 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  25.31 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  25.31 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  24.84 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  23.62 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  29.21 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1412  outer membrane secretion protein U  29.11 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  31.76 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  26 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  29.63 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  24 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  32.37 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  26.05 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  30.68 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  28.74 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>