61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24040 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  100 
 
 		 172 aa  337  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  98.26 
 
 		 172 aa  331  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  63.25 
 
 		 193 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  33.1 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  29.22 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  34.36 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  30.18 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  28.83 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  31.14 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  26.38 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  27.61 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  30.36 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  28.5 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  29.52 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  32.91 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1412  outer membrane secretion protein U  40.46 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  29.95 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  27.06 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  25.15 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  25.15 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  24.55 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  24.55 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  28.57 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  26.67 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  28.82 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  26.57 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  26.57 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  27.03 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  27.56 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2302  general secretion pathway protein H  30.18 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  26.37 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  38.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  32.21 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  30.38 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  29.5 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  36.59 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  43.94 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  65.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  25.41 
 
 		 179 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  23.08 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.79 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  74.07 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.65 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  44.19 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.68 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.68 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.68 
 
 		 130 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  36.26 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  37.88 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.68 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>