91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1312 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  100 
 
 
161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  96.89 
 
 
161 aa  292  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  28.57 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  28.99 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  26.71 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  29.41 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  24.85 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  24.07 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  24.29 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  25.75 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  22.22 
 
 
204 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  22.84 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  22.84 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  22.84 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  31.79 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  23.6 
 
 
180 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  22.36 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  25.7 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  25.7 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  25.14 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  24.31 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  25.14 
 
 
187 aa  53.9  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  35.37 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  24.4 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  21.34 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  20.83 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  24.09 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  23.91 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  23.91 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  21.74 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  30.69 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  23.19 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  23.19 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  21.77 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  21.77 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  37.33 
 
 
187 aa  47.8  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  28.48 
 
 
185 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  27.89 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  33.75 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  30.16 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  37.5 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  31.87 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.35 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  33.33 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  23.45 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  27.71 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  27.27 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.3 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  27.85 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  30.39 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  39.29 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  23.6 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.82 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  28.57 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  34.29 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.67 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  27.47 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  27.47 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02784  hypothetical protein  23.53 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000039643  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0657  hypothetical protein  35.59 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.385115  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  25.74 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  34.33 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  31.76 
 
 
174 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  23.94 
 
 
162 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  28.42 
 
 
174 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.71 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  47.37 
 
 
196 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  27.14 
 
 
179 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  35.38 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  34.67 
 
 
182 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  32.84 
 
 
174 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.65 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  26.67 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.1 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  25.97 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  27.4 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  34.43 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2588  general secretion pathway protein H  23.02 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  48.72 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.55 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  21.79 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  33.33 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.84 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.66 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  38.33 
 
 
162 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  48.72 
 
 
169 aa  40.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>