68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0384 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 169 aa  344  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  99.41 
 
 		 169 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  99.41 
 
 		 169 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  98.82 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  98.82 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  26.55 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  27.04 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  30.29 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  27.06 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  28.81 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  27.44 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  27.06 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  29.65 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  29.65 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  29.65 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  30.52 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  30.52 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  28.05 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  25.44 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  43.42 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  29.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 199 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 199 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 199 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 199 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 199 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  28.37 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  24.5 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  28.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  26.7 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0007  general secretion pathway protein H  29.81 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.183951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  32.63 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  29.41 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  28.57 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  29.37 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  27.12 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  31.73 
 
 		 216 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  41.79 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  26.28 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  28.57 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  26.63 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  30.28 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  37.97 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  22.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  26.25 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0404  hypothetical protein  31.94 
 
 		 360 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2856  general secretion pathway protein H  30.25 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0676  hypothetical protein  42.59 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  32.05 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  26.12 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.48 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  53.33 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>