115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0262 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  58.67 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  41.43 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  52.73 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0337  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  34.34 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  28.89 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  35.63 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  43.4 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  50 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  33.78 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  40.98 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  42.86 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.97 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  27.97 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.85 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  48.89 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  29.31 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  34.12 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  28.93 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  39.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.92 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  43.64 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  34.52 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0371  pilus assembly protein FimT-like  34.56 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0210439  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  43.64 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  41.67 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  38.71 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.11 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  36.07 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.62 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  49.06 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  34.21 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  39.44 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  39.44 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  35.48 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.57 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  39.34 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  27.05 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  43.64 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  38.71 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  30.61 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  33.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  43.64 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  43.33 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.92 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2881  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.13 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  27.97 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.21 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5685  Type IV pilus transmembrane protein, FimT  50.88 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.695953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  31.18 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  29.52 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  24.75 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  24.39 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  31.75 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  44.44 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.06 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  26.88 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  30.95 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  38.18 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  26.01 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.11 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  37.1 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  35.59 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  30.56 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  35.59 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.29 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06981  hypothetical protein  23.97 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  30.47 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  36.21 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.74 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  37.21 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.32 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  36.76 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.5 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  31.75 
 
 		 157 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  25.53 
 
 		 163 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.35 
 
 		 177 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 176 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  27.69 
 
 		 169 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.29 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1091  general secretion pathway protein H  21.88 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.29 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.29 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.43 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  24.65 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>