50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1541 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  88.76 
 
 		 169 aa  313  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  33.73 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  29.52 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  35.12 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  26.9 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  27.04 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  26.99 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.03 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  46.67 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.55 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  30.86 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  40.91 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.57 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  34.33 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  27.71 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.01 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.01 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.82 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  29.03 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  28.38 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  29.41 
 
 		 195 aa  44.3  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.01 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  24.51 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.43 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.85 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0651  methylation site containing protein  25.83 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  33.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  39.66 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  41.54 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0108  pilin  25.35 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  27.69 
 
 		 155 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  25.53 
 
 		 166 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0897  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  42  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 170 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 170 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  29.63 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.38 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  30.3 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  41.67 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.29 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  31.46 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.15 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>