32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2037 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  37.11 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  32.08 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  35.12 
 
 		 169 aa  94.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  35.12 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  35.22 
 
 		 171 aa  94  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  31.61 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  30.07 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  30.82 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  35.42 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  44.64 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.3 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  42.31 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  40 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  42.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  31.3 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0651  methylation site containing protein  28 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  54.55 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  26.32 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  29.01 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.46 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>