22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1537 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  34.81 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  34.36 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  30.86 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  28.65 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  26.9 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  30.07 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  37.31 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  24.12 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  30.23 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  38.6 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  32.58 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1050  general secretion pathway protein H  38.89 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1047  general secretion pathway protein H  38.89 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  35.09 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.64 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  31.25 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  20.41 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  31.91 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  28.05 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  31.03 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  29.81 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>