30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1805 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  35.67 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  30.86 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  34.38 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  32.08 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  32.69 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  33.54 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  34.33 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.03 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  47.06 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  26.73 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  54.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  54.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  54.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  45.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  51.35 
 
 		 145 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  27.27 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.38 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>