188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2876 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2876  methylation  100 
 
 
200 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.9 
 
 
187 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  131  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  40.24 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  35.87 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  41.11 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.52 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  33.14 
 
 
171 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  34.83 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  34.52 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.59 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  34.34 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  32.43 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  33.73 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  33.73 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.82 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  33.52 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.06 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.3 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0856  pilus assembly protein  32 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  32.57 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  35.39 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  35.19 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  42.19 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  32.12 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.46 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  42.19 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  32.53 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  28.86 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.76 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  30.23 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.52 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.71 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  32.16 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.86 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.71 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.71 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.12 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.25 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.42 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.94 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  30.9 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  24.18 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  24.31 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.41 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  34.95 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.21 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.74 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  26.39 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  39.05 
 
 
144 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.21 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.41 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.37 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  29.89 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.71 
 
 
170 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.25 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  38.1 
 
 
144 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  39.22 
 
 
144 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  29.05 
 
 
171 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  35.96 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  35.96 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  29.53 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  32.03 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.93 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  45.71 
 
 
144 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.36 
 
 
151 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  27.84 
 
 
166 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  27.84 
 
 
166 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  37.5 
 
 
145 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  35.96 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  34.44 
 
 
145 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.03 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  30.64 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  35.58 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  31.21 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  33.77 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  42.65 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  24.42 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.75 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1384  fimbrial biogenesis protein  30.82 
 
 
164 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.168846  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0716  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.18 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  26.59 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.37 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.75 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2562  uridylate kinase  29.01 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  33.33 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  27.59 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  33.08 
 
 
185 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  21.18 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  27.49 
 
 
173 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.98 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  32.5 
 
 
157 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  26.4 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.75 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  29.89 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.4 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.7 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.4 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.4 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>