69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0685 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 148 aa  288  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  63.27 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  49.32 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  35 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  32.14 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  32.86 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  30.34 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  30.34 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  35.56 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  30 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  32.17 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  31.79 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  34.04 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.86 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  34.15 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  26.49 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  34.25 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  30 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  31.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.25 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.56 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  39.34 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  29.05 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  29.77 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  26.32 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  31.29 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.09 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  30.67 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  31.76 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.88 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.65 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  33.87 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  28.93 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.11 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.95 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  36.73 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  39.47 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  22.63 
 
 		 166 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 349 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.03 
 
 		 170 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.03 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  35.48 
 
 		 166 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  31.08 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  28.35 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  31.75 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  24.65 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  20.86 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  31.15 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3435  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  46 
 
 		 313 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.03 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  47.92 
 
 		 323 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  30.95 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  26.06 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  30.95 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.75 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  50.91 
 
 		 129 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  40.28 
 
 		 188 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  44.9 
 
 		 362 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  52.17 
 
 		 338 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  34.09 
 
 		 124 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.34 
 
 		 162 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>