104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1068 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 170 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  99.25 
 
 		 170 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  99.25 
 
 		 170 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  73.88 
 
 		 170 aa  221  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  53.5 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  58.78 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  58.21 
 
 		 170 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  57.46 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  57.46 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  56.49 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  53.08 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  55.47 
 
 		 169 aa  153  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.24 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  50.75 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  49.64 
 
 		 178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  48.48 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  49.61 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.04 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.59 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.21 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.21 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.21 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.21 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.42 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  37.31 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  34.68 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  34.68 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  36.09 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  37.6 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  36.84 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  38.81 
 
 		 208 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  34.65 
 
 		 180 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.89 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  33.1 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  30.15 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.95 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  36.36 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  37.62 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  32.59 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.67 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  32.59 
 
 		 192 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.99 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  30.83 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  33.72 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  37.62 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  27.82 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.25 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  27.41 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  24.6 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  29.09 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  30.77 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  27.41 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.58 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.24 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  24.19 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  31.16 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  29 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  36.27 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  28.95 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  27.05 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  30.09 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.58 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  28.72 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  28.18 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  32 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.53 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  31.18 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.95 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.92 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  31.75 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.95 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.89 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  37.1 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  26.57 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.54 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  27.52 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  28.57 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.95 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  24.24 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.47 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0653  type IV pili biogenesis protein FimT  24.59 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.679722  normal  0.506575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.16 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.23 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  30.23 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  34.55 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  26.26 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  24.65 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  25.6 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  36.36 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  29.63 
 
 		 182 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  30.23 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.38 
 
 		 192 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  24.75 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  28.95 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>