89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4848 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  46.2 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  43.53 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4555  type IV pili biogenesis protein FimT  33.53 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.691315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  31.48 
 
 		 171 aa  84.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0648  hypothetical protein  30.59 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  30.59 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0653  type IV pili biogenesis protein FimT  30.81 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.679722  normal  0.506575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.09 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  40 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.82 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  30.9 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  30.18 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  28.28 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  31.25 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.24 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.49 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  40.79 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.24 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.12 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.92 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.23 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  23.81 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  23.89 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  25.75 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.56 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.5 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.05 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  27.88 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.46 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.44 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  26.8 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  21.56 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35.44 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  22.02 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  33.73 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.92 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  27.14 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  26.35 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  23.08 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  32.81 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  26.35 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  31.33 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.76 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.74 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.74 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.74 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.58 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  23.86 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.79 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  29.63 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  26.35 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  22.35 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.46 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  28.33 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  30.12 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  22.35 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  32.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.59 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.59 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.71 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.62 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  24.11 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  26.14 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  22.35 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  30.43 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.49 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  37.68 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  36.23 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  36.23 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36.67 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  36.84 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  28.45 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  27.1 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.27 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.14 
 
 		 173 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  22.29 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.82 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  30.67 
 
 		 155 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  30 
 
 		 160 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  30 
 
 		 160 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  30.68 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.32 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  26.01 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.95 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  27.54 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>