272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4235 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
313 aa  648    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  44.14 
 
 
323 aa  208  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  40.48 
 
 
326 aa  198  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  43.54 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  39.64 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  38.97 
 
 
324 aa  175  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 
321 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  37.99 
 
 
348 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  40.88 
 
 
328 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  39.94 
 
 
332 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  37.06 
 
 
325 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  39.94 
 
 
308 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  40.12 
 
 
318 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  36.27 
 
 
350 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  42.53 
 
 
336 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  35.03 
 
 
349 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  34.68 
 
 
330 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  40.3 
 
 
331 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  38.06 
 
 
340 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  39.1 
 
 
318 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  37.36 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  37.22 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  35.88 
 
 
333 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  36.89 
 
 
341 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  37.85 
 
 
380 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  36.34 
 
 
331 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  36.77 
 
 
334 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  39.38 
 
 
312 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  36.95 
 
 
327 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  36.8 
 
 
319 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  39.23 
 
 
337 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  37.54 
 
 
339 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  36.54 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.15 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  36.39 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  36.13 
 
 
345 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  33.42 
 
 
338 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  35.83 
 
 
352 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  37.07 
 
 
333 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  39.58 
 
 
324 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  35.26 
 
 
386 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  36.54 
 
 
314 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  36.86 
 
 
356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  35.66 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  32.95 
 
 
353 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  35.05 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  44.59 
 
 
367 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  35.08 
 
 
349 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  35.77 
 
 
351 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  35.14 
 
 
361 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  36.81 
 
 
331 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  35.23 
 
 
366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  36.58 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  43.3 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  33.54 
 
 
325 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  42.36 
 
 
363 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  39.09 
 
 
390 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  35.25 
 
 
354 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  33.12 
 
 
338 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 
362 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  30.19 
 
 
326 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  48.48 
 
 
245 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  31.16 
 
 
259 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  51.9 
 
 
383 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  26.64 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  29.73 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  32.93 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  34.06 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  81.67 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  22.68 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  70.69 
 
 
431 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  48.48 
 
 
173 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  25.08 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3830  hypothetical protein  47.3 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  43.66 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  51.79 
 
 
142 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  50 
 
 
142 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  35.64 
 
 
742 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  44.62 
 
 
155 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 
147 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 
141 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  47.37 
 
 
124 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  37.93 
 
 
138 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  34.67 
 
 
768 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
142 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
154 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
148 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
158 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  43.86 
 
 
129 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  35.38 
 
 
122 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  43.86 
 
 
124 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>