24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1524 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  100 
 
 		 140 aa  273  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  35 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  33.79 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  33.79 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  35.42 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  34.75 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  31.47 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  28.06 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.19 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  30.5 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  25.52 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  28.47 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  31.54 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  29.05 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  36.11 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  37.32 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.19 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  41.38 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  33.03 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  28.97 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>