27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2180 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  49.65 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  49.26 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  39.01 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  36.64 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  34.27 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  35 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  31.86 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  34.75 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  29.66 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  30.34 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  26.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  27.97 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  35.58 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  28.21 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  25.36 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  25.36 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  39.78 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  44.62 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  25.9 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>