19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2092 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  100 
 
 		 139 aa  262  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2368  hypothetical protein  27.13 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  30.14 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  30.3 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  29.55 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  27.46 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  31.54 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.67 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  26.43 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  36.19 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.26 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  25.74 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  32.53 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  33.87 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>