31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1056 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  330  7.000000000000001e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0657  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.385115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  33.71 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2368  putative pilin, type IV  34.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  32.14 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  32.79 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  33.01 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  37.14 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.46 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  35.21 
 
 		 188 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  37.31 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.69 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  35.71 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3594  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  37.1 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3597  hypothetical protein  48.94 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  38.33 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  36.19 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  28.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  41.54 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2111  putative pilin, type IV  34.81 
 
 		 159 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.601836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  42.42 
 
 		 179 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  32.26 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  35.38 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  36.23 
 
 		 126 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.85 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  36.07 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.57 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  27.47 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>