20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18670 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  24.65 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  25.17 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  24.79 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  24.79 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  22.56 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  25.19 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  24.65 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  23.74 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  22.92 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  29.11 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  29.51 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  26.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  35.19 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  20.86 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.23 
 
 		 162 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>