41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3664 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  28.06 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  28.26 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  29.66 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  28.17 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.17 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  30.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  30.94 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  31.25 
 
 		 352 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  27.46 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  24.22 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  29.17 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  23.53 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  23.53 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  32.41 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  29.37 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  34.29 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  34.29 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  36.62 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  32.81 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  36.92 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  29.57 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  24.68 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 157 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.89 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  33.03 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.56 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  35.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.11 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  31.17 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  32.11 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  48.98 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  27.1 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  31.96 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>