More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2470 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  95.16 
 
 		 128 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  95.16 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  94.35 
 
 		 124 aa  243  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  77.42 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  77.42 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  70.16 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  58.73 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  61.34 
 
 		 138 aa  157  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  57.6 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  52.85 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  52.5 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  53.33 
 
 		 122 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  56.14 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  52.03 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  50.43 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  54.29 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  46.72 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  39.1 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  48.65 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  43.31 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40.58 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  41.27 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  41.86 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  40.16 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  48.91 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  37.19 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  36.36 
 
 		 223 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  44.16 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  42.86 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.48 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  30.5 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  48.48 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.04 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  36.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.24 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  44.93 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  42.86 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  35.43 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.9 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.03 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  32.99 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  32.99 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  34.18 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  41.03 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  45.45 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  30.95 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  41.43 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  43.24 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  44.29 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  31.41 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.54 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  43.08 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.93 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  39.39 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  30.57 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  37.14 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  33.81 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  31.85 
 
 		 160 aa  57  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  42.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  34.15 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  34.15 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  31.13 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  30.56 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  34.35 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  38.83 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  33.9 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  44.62 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.79 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  34.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  46.03 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.74 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>