44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4407 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  72.85 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  59.62 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  55.06 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  55.77 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  55.06 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  54.78 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  54.32 
 
 		 160 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  55.13 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  55.48 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  53.8 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  54.43 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  54.37 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  47.13 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  50.98 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  50 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  35.12 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  33.96 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  45.61 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  48.15 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  24.68 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  38.98 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  29.41 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  24.16 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  34.55 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  35.09 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.1 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  35.48 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  48.39 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  39.47 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  26.7 
 
 		 188 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  30.12 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.87 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  51.61 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  51.61 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  51.61 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  34.29 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  51.61 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  51.61 
 
 		 201 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  32.84 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  51.61 
 
 		 201 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  51.61 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  32.84 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>