More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0392 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  35.45 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  50 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  31.21 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  45 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  34.88 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  33.86 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  43.04 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  44.07 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  37.18 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  64.71 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  43.66 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  70.97 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  37.18 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.08 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  70.97 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  38.98 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  67.74 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  60.61 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  67.65 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  38.98 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  73.33 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  30.22 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  49.12 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  70 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  59.38 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  62.5 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  60.61 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  40.68 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  42.31 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  31.75 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  30.22 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  59.38 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  70 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  59.38 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  69.44 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  63.64 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  30.22 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  30.65 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  62.5 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  58.7 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  51.85 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  59.38 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  54.35 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.82 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  43.75 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1794  hypothetical protein  63.33 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.786211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  54.35 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  61.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  63.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  58.06 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  53.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  64.71 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  32.06 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  61.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  67.74 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  64.71 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  60 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  70.97 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  54.35 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.24 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  66.67 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  66.67 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  28.06 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.97 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  63.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  66.67 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  48.89 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  70.37 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  23.93 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.14 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  66.67 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.14 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  66.67 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  61.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  46 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  64.71 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  61.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  65.62 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  61.29 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  61.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  57.58 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  61.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  68.75 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.14 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  70 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  57.58 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  46.94 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  67.74 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  63.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.37 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  67.74 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>