80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3267 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  283  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  39.56 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  33.12 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  33.83 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  33.12 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  32.05 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  32.69 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  32.69 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  31.41 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  43.86 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  36.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  30.13 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  29.87 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  32.05 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  29.56 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  30.13 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.14 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  29.41 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  27.81 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  42.11 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  30.13 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  36.05 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  60.61 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  38.96 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  43.4 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  28.48 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  43.4 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  52.17 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  60.61 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  45.28 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  43.48 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  44.07 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  62.07 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  38.89 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  27.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  38.89 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  60 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  41.51 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  37.93 
 
 		 159 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  41.51 
 
 		 173 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  37.08 
 
 		 186 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  36.36 
 
 		 178 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  62.07 
 
 		 193 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  38.03 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  39.66 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  41.3 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  62.07 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  44.83 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  47.83 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  56.67 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  43.48 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  41.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  30.88 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  41.51 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  53.33 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  41.51 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  56.67 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  47.83 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  61.29 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  56.67 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  56.67 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  39.62 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  39.62 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  56.67 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  51.61 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  51.61 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  51.61 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  28.77 
 
 		 126 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  40 
 
 		 165 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>