18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1796 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1032  hypothetical protein  68.97 
 
 		 145 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.332642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1416  hypothetical protein  32.48 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00239057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  29.5 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  31.48 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1794  hypothetical protein  56.76 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.786211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  54.05 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  31.43 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  24.63 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  31.52 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  29.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  34.04 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  34.69 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  25 
 
 		 153 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  26.96 
 
 		 172 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>