61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0517 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  95.68 
 
 		 162 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  93.21 
 
 		 162 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  93.12 
 
 		 160 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  79.62 
 
 		 157 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  77.16 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  75.93 
 
 		 162 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  75.93 
 
 		 162 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  74.07 
 
 		 162 aa  240  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  53.75 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  55.13 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  53.8 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  52.6 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  51.3 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  49.68 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  52.6 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  34.66 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  31.85 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  32.57 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  30.67 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  32.3 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  35.63 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  37.18 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  30.13 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  32.56 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  34.55 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  27.91 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  28.89 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  30.09 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  37.93 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  30.63 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  32.29 
 
 		 206 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  25.95 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  58.06 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  29.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  36.73 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  36.73 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  30.36 
 
 		 157 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  23.16 
 
 		 204 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  41.18 
 
 		 157 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  45.65 
 
 		 176 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  41.18 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  61.29 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  51.52 
 
 		 156 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  40.74 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  51.61 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  34.43 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  54.55 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  40 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  54.84 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  26.15 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  51.61 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  54.84 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  32.84 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  43.48 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  40 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  31.48 
 
 		 567 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  26.6 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  30.34 
 
 		 231 aa  40.4  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>