97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0755 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  38.04 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0884  N-terminal methylation site  38.06 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0560375  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  33.83 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  32.95 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  47.27 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  43.33 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  38.03 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  38.98 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  24.68 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  43.24 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  38.89 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  25.95 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  38.1 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  25.95 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  37.93 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.39 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  25.16 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  73.08 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  73.08 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  70.37 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  47.37 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  30.56 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  66.67 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  69.23 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  69.23 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  36.54 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  25.95 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  36.62 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  37.5 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  25.47 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  27.88 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  25.95 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  27.27 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  28.19 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  62.96 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  38.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  62.07 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  24.4 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  46.15 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  24.4 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  46.15 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  51.52 
 
 		 148 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  57.14 
 
 		 212 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  44.12 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.9 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  59.26 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  69.23 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  33.03 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1277  general secretion pathway protein H  28.26 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.48 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  55.17 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  60.71 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  69.23 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  59.26 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  30.99 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  59.26 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  28.57 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  30.65 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  60.71 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.9 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  48.72 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  43.64 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  51.72 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  40.3 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  43.59 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  48.48 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  51.72 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  48.39 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  36.21 
 
 		 225 aa  40.8  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  27.71 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  45.16 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  29.03 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  32.56 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  32.39 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  46.15 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  29.03 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  37.5 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  29.03 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  37.5 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  46.15 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  37.5 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  37.5 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  44.12 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  25.97 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  48.65 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>