More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0534 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.47 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  34.88 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.21 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  39.39 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.56 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  42.42 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  40.68 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  42.42 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  39.39 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  39.39 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  41.54 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  36.36 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  27.48 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  37.88 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  45 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  38.57 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  33.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.68 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  38.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  35.56 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  38.81 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  27.35 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  46.55 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.98 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  43.33 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  38.46 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  28.8 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  38.46 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 		 169 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  42.62 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.11 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  38.6 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.29 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  39.19 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.09 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.29 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  42.37 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.59 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  37.93 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  39.29 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  37.66 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  32.31 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.62 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  26.4 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  39.66 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  34.18 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  33.02 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  28.69 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.76 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  35.8 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  29.81 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  37.7 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  30.36 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  40.82 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.9 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  44.23 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.25 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.29 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  34.92 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  29.13 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.66 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  28.36 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  32.43 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  27.05 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  27.87 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  32.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  28.45 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  33.9 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  40 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  37.5 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.78 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  40 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  47.5 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  32.86 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  35.9 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  41.3 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  35.59 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>