192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0115 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  52.5 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  47.87 
 
 
186 aa  83.6  8e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  55.71 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  67.8 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  36.96 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  61.02 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  66.67 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  85.71 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  54.55 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  54.55 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  60.66 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  39.18 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  38.24 
 
 
169 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  37 
 
 
171 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  47.06 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  69.05 
 
 
141 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  37.12 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  35.06 
 
 
190 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  50.88 
 
 
202 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
154 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  62.5 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  49.12 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  49.12 
 
 
205 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  50.91 
 
 
205 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  54.9 
 
 
232 aa  50.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  50.91 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  50.91 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  50.91 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  49.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  50.91 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  66.67 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  45.61 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  55.1 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  47.37 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  49.09 
 
 
205 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  43.08 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  43.86 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  34.85 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  34.85 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  36.21 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  57.14 
 
 
210 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  41.03 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  64.71 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  25.83 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  29.27 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  40.74 
 
 
168 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  43.86 
 
 
205 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  40 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  65.71 
 
 
231 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  43.86 
 
 
201 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  60 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  44.68 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.62 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  58.33 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  58.82 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  37.68 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  27.78 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.06 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  63.64 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  54.29 
 
 
212 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  26.55 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  25.98 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  50 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  29.11 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  29.11 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  28.46 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  56.76 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.29 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.57 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  60 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>