119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0962 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  27.59 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  36.36 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  48.89 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.45 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  27.19 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  31.82 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  37.93 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  31.51 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.11 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.97 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  38 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  26.37 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  38.46 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  43.4 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  44.19 
 
 		 133 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  33.96 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  27.98 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  29.03 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  35.71 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  28.72 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  24.75 
 
 		 155 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  33.33 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  26.47 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  38 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  30.56 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  40.48 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  33.9 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  37.25 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.78 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.93 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  39.13 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  39.22 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  32.14 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  40.74 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.14 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  56.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  31.43 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  42.31 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  43.59 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.78 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.22 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  26.87 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  41.38 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  24.67 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  44.19 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  23.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  56.67 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  46.51 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  35.42 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  26.15 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  38 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.61 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  32.26 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  34 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  45.1 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  26.23 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  35.42 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.76 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  34.55 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  41.03 
 
 		 169 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.36 
 
 		 194 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  28.07 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  51.61 
 
 		 147 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.18 
 
 		 173 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  32.65 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.03 
 
 		 168 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 165 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  48.39 
 
 		 179 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.69 
 
 		 178 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  41.3 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  51.72 
 
 		 70 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  34.67 
 
 		 185 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0108  pilin  24.24 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  44.19 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  51.61 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  41.86 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  43.59 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  46.67 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 169 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.06 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  28.57 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  51.72 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  37.21 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  43.14 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  51.72 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>