More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1201 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  100 
 
 
189 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1163  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  31.52 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  36.73 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.85 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.96 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.39 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  44 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.93 
 
 
167 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 
152 aa  62  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07041  hypothetical protein  22.22 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.540134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 
159 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.79 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.52 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.11 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.23 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.07 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.08 
 
 
151 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 
165 aa  57.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.92 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  45.61 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.14 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 
147 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  36.49 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  44.78 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  44.62 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  46.55 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  46.55 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.46 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07091  hypothetical protein  25.75 
 
 
263 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  47.69 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.28 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
171 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  54 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  42.03 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.08 
 
 
179 aa  55.1  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  42.03 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.3 
 
 
154 aa  55.1  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  42.86 
 
 
172 aa  54.7  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  35.71 
 
 
172 aa  54.3  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.76 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  43.33 
 
 
141 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.63 
 
 
121 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.38 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.27 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  42.42 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.47 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.5 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.28 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  34.07 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.61 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  41.67 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  42.11 
 
 
133 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  36.17 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  47.37 
 
 
79 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  29.21 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  25.2 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.28 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  40.3 
 
 
155 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  64.1 
 
 
158 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  42.11 
 
 
133 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  38.81 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.31 
 
 
142 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 
163 aa  51.2  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  36.51 
 
 
160 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  43.1 
 
 
163 aa  51.2  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  40.28 
 
 
136 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  40.28 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  42.86 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  39.66 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  32.76 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  38.89 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  42.03 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  38.18 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  61.54 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  36.92 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.62 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  37.33 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.54 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  43.86 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  59.52 
 
 
48 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  44.83 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.46 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.37 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  38.89 
 
 
136 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  42.55 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  44.23 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>