More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0669 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  100 
 
 
48 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  81.25 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  82.61 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  90.48 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  80.85 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.61 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  86.05 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  84.44 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  84.78 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  80.43 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  86.67 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  80.43 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.61 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  84.78 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  85.71 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  80.43 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  80 
 
 
171 aa  72  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  78.26 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.61 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.61 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  92.31 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  81.4 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  85.71 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  81.4 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  80.43 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  85 
 
 
168 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  81.82 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  85.71 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  78.26 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  85.37 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  76.09 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  83.33 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  89.74 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  73.91 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.91 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  76.09 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  81.4 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.91 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  80.43 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  75 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.91 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  89.47 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  89.74 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  76.09 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  73.17 
 
 
527 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  73.17 
 
 
634 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  73.91 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  71.74 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.91 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.05 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  75 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  73.81 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  72.5 
 
 
567 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  72.92 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  86.11 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  68.89 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  76.19 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  72.5 
 
 
174 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  71.11 
 
 
182 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  69.23 
 
 
548 aa  60.1  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  83.33 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.79 
 
 
174 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  76.32 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  60.47 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  60.47 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  84.85 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  57.14 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  63.16 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  58.7 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  65 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  65 
 
 
137 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  58.14 
 
 
174 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  71.05 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  65 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  53.33 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  61.54 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  62.5 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  61.54 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  54.76 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.45 
 
 
166 aa  50.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  56.41 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  71.05 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  71.05 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  56.41 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55.81 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  61.54 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  65.71 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  57.5 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  50 
 
 
199 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  53.19 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  53.33 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  59.52 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  60 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  61.54 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  61.54 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  60.53 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  57.89 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  58.54 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>