More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1524 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
159 aa  326  8e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.71 
 
 
163 aa  110  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  45.64 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.86 
 
 
156 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.9 
 
 
169 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.06 
 
 
157 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  58.76 
 
 
163 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.33 
 
 
155 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.97 
 
 
167 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.51 
 
 
166 aa  101  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.03 
 
 
165 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.21 
 
 
158 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.74 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 
169 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.22 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.48 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  67.19 
 
 
165 aa  94  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.03 
 
 
155 aa  94  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.12 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  70.31 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.89 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.67 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.12 
 
 
175 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  52 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  43.79 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.47 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  63.51 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  45.74 
 
 
136 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.87 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.51 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  61.84 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.16 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 
193 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.29 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  63.38 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.7 
 
 
167 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  38.07 
 
 
174 aa  84.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  35.62 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.86 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.58 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  38.06 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  37.14 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  60.27 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.72 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  46.15 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  61.11 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.63 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  43.36 
 
 
527 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  42.48 
 
 
634 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  76.47 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.71 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  42.86 
 
 
567 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  80.43 
 
 
48 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.62 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  42.34 
 
 
548 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  40.68 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  40.4 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  37.61 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  44.26 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  55.36 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  50 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  46.88 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  52.83 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  46.48 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  49.06 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  60.47 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.05 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  35.19 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  33.86 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  39.24 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  42.42 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  60.47 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  40.98 
 
 
208 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.5 
 
 
141 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  49.06 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  39.24 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  55.77 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  39.24 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  55.77 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  53.85 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  39.51 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  37.4 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  41.54 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  42.86 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  40.58 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  50.94 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.25 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  50 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  37.5 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  54.39 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.67 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>