106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0526 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  329  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  49.37 
 
 
168 aa  147  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.58 
 
 
161 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.19 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.66 
 
 
175 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.89 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.78 
 
 
158 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  35.12 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  48.94 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.06 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.95 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.58 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.58 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.06 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  56.06 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.05 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.5 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.3 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.42 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.12 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.69 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  53.97 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  54.55 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  57.58 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  33.96 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.83 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.99 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.29 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.45 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.66 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.03 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.95 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.94 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  48.75 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.38 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.42 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.68 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  47.83 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.46 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  55.56 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 
165 aa  60.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  32.89 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.57 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  51.72 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50.91 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50.85 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.69 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  43.55 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  39.71 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.53 
 
 
157 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  36.51 
 
 
174 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  43.1 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  43.4 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  41.18 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  65.71 
 
 
48 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  40.3 
 
 
567 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  40.3 
 
 
527 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  41.51 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  39.66 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  40.3 
 
 
634 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  26.17 
 
 
158 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  33.87 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.33 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  41.18 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  33.33 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  33.33 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  39.66 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  46.34 
 
 
548 aa  44.3  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  37.93 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  38.89 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  27.27 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  41.51 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  32.35 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.34 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  36.21 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  36.21 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  32.76 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  28.79 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  36.21 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 
170 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  36.21 
 
 
124 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  36.9 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  37.5 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.48 
 
 
124 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.78 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  38.1 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  35.19 
 
 
199 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  40.38 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  50 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0357739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>