More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0682 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
165 aa  338  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.75 
 
 
154 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.26 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  39.72 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.74 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.06 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.99 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  37.72 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.9 
 
 
169 aa  84  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.11 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.13 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.77 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  54.55 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.71 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.21 
 
 
193 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.76 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.93 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.69 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.37 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.42 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.71 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.53 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  51.35 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.21 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.82 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.52 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.91 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  41.35 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.94 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  58.82 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  54.17 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.65 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  57.97 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  70.18 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  54.05 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  39.02 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.07 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.62 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.62 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.21 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.41 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  60.71 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  62.75 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.32 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.3 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.74 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  32.98 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  45.16 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  76.19 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  62.26 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.64 
 
 
135 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  50.85 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  40.79 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  47.06 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  49.23 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  49.23 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  35.79 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  38.55 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  47.76 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  46.03 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  61.9 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  42.86 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  55.36 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  55.93 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  46.03 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  45.65 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  41.43 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  37.21 
 
 
166 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  45.71 
 
 
128 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  45.71 
 
 
124 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  36.46 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  44.29 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  50.82 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  40.54 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  53.57 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  55.56 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  32.95 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  40 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.04 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  44.78 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  43.94 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  45.59 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  44.29 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  42.53 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  47.06 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  47.06 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  44.29 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  44.44 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  35.35 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>