More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0788 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  100 
 
 
79 aa  156  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  77.03 
 
 
169 aa  111  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  72.73 
 
 
156 aa  107  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  72.37 
 
 
163 aa  105  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.42 
 
 
175 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.33 
 
 
147 aa  101  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.92 
 
 
169 aa  100  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.83 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.94 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 
167 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.12 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.5 
 
 
157 aa  97.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.47 
 
 
156 aa  97.4  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.94 
 
 
193 aa  97.1  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.29 
 
 
165 aa  96.7  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.33 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.22 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  64.94 
 
 
168 aa  94.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  66.67 
 
 
172 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.22 
 
 
168 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  68.06 
 
 
171 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.12 
 
 
170 aa  94  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  69.44 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.38 
 
 
163 aa  93.2  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.57 
 
 
166 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  68.49 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.33 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  65 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  65.85 
 
 
172 aa  90.9  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.26 
 
 
172 aa  90.9  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.79 
 
 
179 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  64.38 
 
 
174 aa  89.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.51 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  61.54 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  63.64 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.46 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.54 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  60 
 
 
171 aa  87  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.38 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.33 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.9 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  57.69 
 
 
169 aa  84.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  64.29 
 
 
182 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  64.62 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  61.33 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.11 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  56.06 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  53.75 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  72.88 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  58.33 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  80.43 
 
 
48 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.26 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.93 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  61.67 
 
 
634 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  61.67 
 
 
527 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  59.32 
 
 
548 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  62.07 
 
 
567 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  43.84 
 
 
174 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  45.45 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  47.54 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.22 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.61 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.61 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  40.51 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  55.81 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  50.94 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  55.81 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  50 
 
 
188 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.18 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  46.67 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  41.33 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  52.46 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  48.08 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  46.67 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  39.39 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  39.39 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  47.62 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  51.92 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  42.37 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  41.33 
 
 
111 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  47.37 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  51.06 
 
 
169 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.76 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  44.29 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  45.76 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  44.62 
 
 
153 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  49.09 
 
 
151 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  48.08 
 
 
141 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  46.15 
 
 
134 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  46.77 
 
 
174 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  42.59 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  42.37 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>